子連れ(3歳と6カ月の2人)で今日1730-1800頃に行ける美味しいお店ありますか？ 6カ月の子供が入れる、くつろげるというのが優先です

3歳と6ヶ月の二人！？双子ぺこ！？おこさまたくさんぺこなー！

Ark Lounge 新宿西口駅前店(新宿西口/居酒屋) | ホットペッパーグルメ
http://www.hotpepper.jp/strJ001051217/

こちらのイタリアンダイニングはいかがでしょうか？
ソファの個室あるのでお子様連れも安心して利用できそうでおすすめです。

口コミ一覧 : 土古里 新宿NOWAビル店 （トコリ）[食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1304/A130401/13139065/dtlrvwlst/

赤ちゃん連れでもゆっくりできる雰囲気です。居酒屋さんですが候補の１つにどうぞ

あー！ごめんぺこ！勘違いしちゃったぺこ！（笑）

KICHIRI　MOLLIS （キチリ モリス） - 新宿三丁目/ダイニングバー [食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1304/A130401/13174169/

こちらは赤ちゃん連れの方によく利用されています。
利用しやすいですし、お店の方も対応に慣れています。
空きがあるか確認してからだと確実かと。