東京駅で３名、取引先との接待で予算6,000円くらい。料理ジャンルは問いません。

接待のお店リサーチぺこな！
うめちゃん幹事さんぺこ？ファイトぺこ！

菜な 丸の内店 - 東京/居酒屋 [食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1302/A130201/13153719/

こちらどうでしょう！
落ち着いた居酒屋さんで個室があります。
一応こちらのサイトには6名からとなってますが予約でいけると思いますよー！
美味しい和食のお店お店で、予算くらいでいけます。

さば銀 （メニュー/クーポン） - ぐるなび
http://r.gnavi.co.jp/sbxubpen0000/

オススメですよ〜

菜な 丸の内店 - 東京/居酒屋 [食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1302/A130201/13153719/

キッテ内にある、京料理がいただけるこちらのお店はいかがでしょう？東京駅が見える景色良い綺麗な店内で、個室もありますよ！

海賓亭 （メニュー/クーポン） - ぐるなび
http://r.gnavi.co.jp/g025006/

南口徒歩1分のこちらのお店はいかがですか？
新鮮な活魚が頂けますよ。
個室もあるので接待に良いかと思います