都内でナポリピッツアではないピッツアが美味しくてワインも揃っているお店ありますか？ 代々木のイル・ペンティートは行ったことあります。

ナポリピッツァとは！

ナポリピッツァの基礎知識
http://www.nisshin.com/entertainment/italian/pizza/

マルゲリータとかそういうのぺこかな。。？

マッシモッタヴィオ - レストラン／カフェ - 新宿／渋谷／世田谷／中野／杉並／練馬 - 東京
http://www.timeout.jp/s/ja/tokyo/venue/16030
こちらのお店はどうでしょう？
お酒も豊富でピザの生地が一味違うみたいですよ！
ナポリピザじゃない！をうたい文句にしてるようです^ ^

ウラコナ 渋谷神泉店 （uraCONA） - 神泉/ピザ [食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1303/A130301/13110653/
150種類のワインと明太ピザやシラスのピザなんてどうですか？(*^^*)

クラウディアツー （Claudia2） - 新宿三丁目/ピザ [食べログ]
http://s.tabelog.com/tokyo/A1304/A130401/13161411/
新宿にあるこちらはどうでしょ？
ピザの種類も多く本格的な感じです✨ワイン片手にピッツアをディナーなんて羨ましいです…！

中目黒の聖林館がおすすめです。

あとは、中目黒のDROP、おすすめですー！

ケ ヴォーリア 三越前
http://s.tabelog.com/tokyo/A1302/A130202/13117739/

イタリアで修行した料理長がイタリア産石窯で焼いたできたてミラノピッツァを出してくれます。
本場のミラノピッツァを堪能できます！
オススメですよ。